sed: я просто оставлю это здесь...

sed -e :a -e 's/\(^[A-Z]\)[a-z]*\t\([A-Z][a-z]*$\)/\1.\2/;ta' FNameSName.list | tr '[:upper:]' '[:lower:]' 

exmpl

Petr    Ivanov - > p.ivanov
Stepan  Petrov - > s.petrov
...